上海市閔行區中心醫院創建于1969年。1995年成為二級甲等綜合性醫院，2020年成為三級乙等綜合性醫院。2000-2014年為瑞金醫院集團成員單位。2014年閔行區人民政府與復旦大學合作共建，籌建復旦大學附屬醫院。2017年簽約組建 中山醫院-閔行區中心醫院閔行醫療聯合體 ，成為復旦大學附屬中山醫院閔行分院。2018年正式列為復旦大學附屬醫院（非直屬）。經過近50年的發展，醫院現占地面積5.59萬平方米，建筑面積10.8萬平方米。全院核定床位800張，實際開放床位1000余張。擁有3.0T核磁共振、第三代雙源CT（FORCE）、飛利浦FD20DSA機等大型醫療設備。醫院科室設置齊全，現有臨床、醫技科室38個。2017年門急診量251.1萬人次，出院4.1萬人次，手術2.3萬人次，平均住院天數8.00天?，F有職工近2000人，其中專業技術人員1400余人，中高級職稱近800人，博士、碩士300余人，近300人取得教師資格證書。
醫院2009年被認定為上海市急性創傷急救中心。2013年經國家食品藥品監督管理總局批準，取得藥物臨床試驗機構資格（GCP），現有專業組10個。醫院有上海市醫學重點?？?個，多個區特色?？?，確定消化（內鏡）、骨科（康復）作為區域大學科建設方向，持續推進院級重點學科建設。我院急診醫學科與中山醫院等合作建設上海市重點薄弱學科。創建成為 全國中醫藥工作示范單位 。與復旦大學共建以來，建成上海市醫療系統首家、體制內首家院士工作站，周良輔、葛均波和顧玉東三位院士及專家團隊來院指導，加入復旦大學兒科、婦產科醫聯體，建立復旦大學附屬紅房子醫院專家團隊工作室、 大國工匠 周平紅教授內鏡工作站，共建復旦大學生物醫學研究院閔行分院、復旦大學生物醫學研究院康復醫學研究中心、上海市臨床生物信息研究所腫瘤生物信息研究中心、上海市消化內鏡工程技術研究中心閔行分中心、上海復旦臨床病理診斷中心-閔行區疑難病理會診平臺。
2014年成為復旦大學研究生培養單位，有復旦大學博導5名，碩導12名?，F有市住院醫師規范化培訓基地9個，是8家醫學院校教學、實習基地，承擔復旦大學、溫州醫科大學、皖南醫學院等院校教學任務。
醫院現已成為立足閔行、輻射上海市西南區域的醫療中心。
